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01、質(zhì)譜不出峰的可能原因
（1）進(jìn)樣系統(tǒng)與離子源沒連接或有漏液
（2）六通閥漏液
（3）霧化氣沒開
（4）噴霧電壓沒有
（5）離子進(jìn)入分析器的離子通道堵塞
（6）噴霧毛細(xì)管堵塞
02、如何根據(jù)樣品選擇離子源
可根據(jù)分子量的大小、極性。APCI適合小分子，極性小的化合物；ESI適合分析的分子量范圍較大、分子要求帶有一定極性。一般先考慮用ESI分析，如果極性實(shí)在太小，才想到用APCI。
03、等度還是梯度洗脫如何選擇
其實(shí)只做一兩個化合物，是等度洗脫好，速度快，但也并非越快越好，特別在分析生物樣品時，考慮到基質(zhì)效應(yīng)，保留因子控制在2-3左右較好。梯度洗脫適合分析多個結(jié)構(gòu)不同的物質(zhì)，如化合物與代謝產(chǎn)物一同鑒定的時候，比如苷和苷元的一同測定。另外很多做合成化學(xué)的分析實(shí)驗(yàn)室用的也是一通用的梯度洗脫方法，一個方法搞定大部分樣品。一般來說對于組成簡單的樣品可以采用等度洗脫，而對于那些復(fù)雜的樣品分離通常需要進(jìn)行梯度洗脫。
04、氣質(zhì)和液質(zhì)系統(tǒng)對比
除了采用的分離手段不同（氣相和液相）外主要的區(qū)別在于真空系統(tǒng)和電離方式。氣質(zhì)的真空系統(tǒng)比較簡單，只要一個小的機(jī)械泵和一個分子渦輪泵就可以了。液質(zhì)的機(jī)械泵要比氣質(zhì)大，需要兩個分子渦輪泵。氣質(zhì)的電離方式有電子電離(EI)和化學(xué)電離(CI)。液質(zhì)的電離方式有電噴霧電離(ESI)、大氣壓化學(xué)電離(APCI)和大氣壓光電離(APPI)。
05、APCI和ESI的不同點(diǎn)
（1）離子產(chǎn)生的方式不同。APCI利用電暈放電離子化，氣相離子化。ESI利用離子蒸發(fā)，液相離子化。
（2）能被分析的化合物類型不同。APCI適合弱極性，小分子化合物，且具有一定的揮發(fā)性；ESI 極性化合物和生物大分子。
（3）流速不同。ESI一般流速較小，約0.001到0.25 mL/min，APCI 相對較大，約0.2到2 mL/min。
（4）多電荷。APCI不能生成一系列多電荷離子，所以不適合分析大分子；ESI 能生成一系列多電荷離子，特別適用于蛋白，多肽類等生物分子。
06、CID和CAD區(qū)別
CID（collision-induced dissociation）：
碰撞誘導(dǎo)解離。通常在真空接口處調(diào)節(jié)電壓發(fā)生CID現(xiàn)象，一般是去除溶劑，如果電壓增大，也會產(chǎn)生碎片離子。這是一級質(zhì)譜的原理。
CAD（collision-activated dissociation）：
碰撞活化解離。做二級質(zhì)譜時，選擇的母離子進(jìn)入Q2后，碰撞活化產(chǎn)生子離子，這個過程稱為 CAD。
以API3200譜儀為例，CID指的是Q0里面的誘導(dǎo)碰撞的氣體，CAD指的是Q3里面的誘導(dǎo)碰撞氣體。也就是說，在這里的CID&CAD都是指氮?dú)狻?
07、氮?dú)獍l(fā)生器該使用嗎
氮?dú)獍l(fā)生器的工作原理是分離空氣，電解膜的負(fù)極側(cè)發(fā)生氧化反應(yīng)，“吃掉”空氣中的氧化性氣體，在正極側(cè)還原，空氣流過電解池后就只剩下氮?dú)夂投栊詺怏w。故國內(nèi)發(fā)生器的純度大多標(biāo)有“相對含氧量”。氮?dú)獾募兌群涂諝饬魉佟⒂行Х纸饷娴拈L度、電解電勢的強(qiáng)弱都有關(guān)系。這種分離方法也決定了氮?dú)獾募兌炔豢赡茏龅暮芨摺＜尤腚娊赓|(zhì)的作用就是提高水的導(dǎo)電率，使電化學(xué)反應(yīng)能順利進(jìn)行。發(fā)生器對質(zhì)譜的影響有一點(diǎn)常常被忽略，就是發(fā)生器內(nèi)的開關(guān)電源工作時會對電網(wǎng)電壓造成一定的干擾（壓縮機(jī)的啟動和停止也會）。
08、串聯(lián)質(zhì)譜如何定量
串聯(lián)質(zhì)譜定量時,是以后面產(chǎn)生的碎片峰（子離子）定量。但是這一子離子是由母離子在碰撞室產(chǎn)生的特征性碎片，所以用MRM定量靈敏度會比用SIM定量好很多。
建立方法的步驟是：用一定溶度的標(biāo)準(zhǔn)品溶液（1-10 ug/mL）調(diào)諧化合物的一級質(zhì)譜條件，找到母離子的[敏感詞]質(zhì)譜條件。然后對母離子進(jìn)行打碎，優(yōu)化碰撞能量，得到其特征性的子離子。最后利用該質(zhì)譜條件和該母離子->子離子對進(jìn)行定量。
09、質(zhì)量偏差怎么辦
質(zhì)譜的質(zhì)量數(shù)偏了，說明你的儀器該校正了，一般3個月就要校一次機(jī)。一般每個廠家都會隨機(jī)帶有校正液。
10、如何更換機(jī)械泵油
一般3個月到半年更換一次泵油，可同時停機(jī)對儀器進(jìn)行一次清洗。更換泵油的時候，先開啟振氣閥5-10分鐘，待將泵內(nèi)沉淀振起后，關(guān)閉振氣閥，同時關(guān)閉電源。打開泵下的泵油排放閥門，放掉舊油。如果泵油已經(jīng)很臟，則可取少許新油清洗泵后放掉再注入新油。
11、碰撞室離子交互影響的原因及消除
多通道掃描（MRM）時，如果兩個離子掃描通道的碎片離子一樣（或類似如相差1-2分子量單位），前一個離子通道掃描結(jié)束后，碰撞室里的離子來不及清除，影響下一個離子通道反應(yīng)的定量（如果色譜分離完全則無此影響）。
可能的消除方法：
（1）選擇特異的子離子（特別是在用穩(wěn)定同位素內(nèi)標(biāo)時）
（2）增加離子通道掃描反應(yīng)之間的時間間隔（如100 ms→300 ms）
（3）可設(shè)置額外的“無用的離子掃描通道（dummy MRM）”
12、排除色譜柱流失問題的有效方法
診斷色譜柱是否存在流失問題的方法是[敏感詞]次在方法條件下安裝色譜柱時，做一次空白色譜圖，然后將最近的運(yùn)行和空白運(yùn)行色譜圖對比。
如果在空白運(yùn)行中產(chǎn)生了很多峰，則色譜柱性能改變，這可能是由于載氣中含有氧氣，也可能是由于樣品殘留。
如果有 GC-MS，則低極性色譜柱的典型流失離子（例如 DB/HP-1或5）質(zhì)/荷比m/z 將為 207、73、281、355 等，大多數(shù)為環(huán)硅氧烷。
13、譜圖為什么只有溶劑峰
可能有以下原因：
（1）進(jìn)樣針損壞
（2）載氣流速太低
（3）樣品濃度太低
（4）樣品被柱或進(jìn)樣器襯套吸附
14、質(zhì)譜基線高是什么原因
質(zhì)譜的基線其實(shí)跟液相的紫外檢測器和熒光檢測器一樣，基線高的原因不外乎內(nèi)部和外部的原因。
（1）選擇的流動相在質(zhì)譜的響應(yīng)比較高，比如水相比較多的時候，噪音比較大些；還有如果鹽含量比較大的時候，噪音更大些。
（2）檢測器的靈敏度越高的時候，噪音應(yīng)該越高。如果質(zhì)譜的污染比較嚴(yán)重時，基線肯定比較高。比如離子阱檢測器，用得久了，阱中的離子就會增多，一方面降低了質(zhì)譜的靈敏度，另一方面增加了基線噪音。
（3）質(zhì)譜的基線很多時候還跟你選擇的離子寬度有關(guān)。比如作選擇離子掃描的時候，基線就低些。作選擇反應(yīng)掃描的時候，離子寬度不要選得太寬，太寬噪音就高些。
（4）多級質(zhì)譜一般做二級或三級質(zhì)譜，基線噪音就低很多。
質(zhì)譜使用的注意事項(xiàng)：
（1）[敏感詞]不用直接進(jìn)樣（容易污染離子源）。
（2）做聯(lián)用時[敏感詞]分流（縮短分析時間、延長質(zhì)量分析器壽命）。
（3）[敏感詞]使用在線切換閥，將每個樣品的前后1－2分鐘的流動相切入廢液（避免樣品中的鹽進(jìn)入質(zhì)譜。做Sequence時可以把平衡柱子的流動相切入廢液）。
（4）開始聯(lián)用前，直接運(yùn)行質(zhì)譜數(shù)分鐘，可以先將溫度（毛細(xì)管溫度和離子源溫度（APCI））加熱到預(yù)設(shè)定值。
（5）待機(jī)時將切換閥置于waste，避免剛開液相時將流動相打入離子源。
（6）關(guān)機(jī)前毛細(xì)管的溫度先降下來，穩(wěn)定一段時間后再關(guān)閉電源，避免風(fēng)扇停止轉(zhuǎn)動后毛細(xì)管外圍的熱量向里擴(kuò)散，容易引起內(nèi)部線路及電子元器件老化加速。
（7）如果用的是鋼瓶而且天天做樣的話，可將兩個鋼瓶并聯(lián)。
（8）做定量時注意離子源噴針的具體位置，否則可能會影響標(biāo)準(zhǔn)曲線。
（9）如果是負(fù)離子檢測的話，可以向流動相中加入少量異丙醇。
（10）理論上液質(zhì)聯(lián)用禁止使用任何不揮發(fā)性的緩沖鹽。如果需要，盡量使用諸如乙酸氨等揮發(fā)性鹽，濃度不要超過20mmol/L。對于不揮發(fā)性的緩沖鹽，如果你的儀器有吹掃捕集的話也可使用，但一定要小心。萬不得已也不要用，首先有不揮發(fā)鹽是得不到好的離子流的，其次鹽留在質(zhì)譜中很難除掉，除非停機(jī)清洗，不然一直會影響其他樣品的分析。可以找質(zhì)譜友好的條件來做液質(zhì)聯(lián)機(jī)，例如色譜條件為20mM磷酸鹽的水/乙腈流動相，做液質(zhì)聯(lián)機(jī)的時候就可以用醋酸銨代替，然后用醋酸調(diào)節(jié)pH值與磷酸鹽的一致即可。除了難揮發(fā)的鹽，三乙胺、表面活性劑、還有高濃度（>0.5%）的TFA，都對質(zhì)譜不好，液質(zhì)聯(lián)用的流動相中應(yīng)該避免。
（11）需要使用酸的情況下可以用甲酸、乙酸，三氟乙酸可以用，但能用甲酸或乙酸時就別用TFA。
（12）胺類物質(zhì)做ESI質(zhì)譜時要注意進(jìn)樣量要少，因?yàn)楹苋菀纂x子化，不易沖洗干凈，會影響后面樣品的測定。像三乙胺在液質(zhì)聯(lián)用時不能用于調(diào)節(jié)流動相pH值。若不慎引入三乙胺，在正離子檢測時總會出現(xiàn)很強(qiáng)的102峰。
（13）酸性物質(zhì)適合做負(fù)離子檢測，所以流動相偏堿性較合適，促使其解離，堿性物質(zhì)適合做正離子檢測，流動相中適當(dāng)?shù)募尤胨幔偈蛊湫纬烧x子，流動相中適當(dāng)加一些醋酸鈉（或者醋酸銨），可形成加鈉的正離子或者加銨的正離子。